就方法论而言，中西文化之不同集中表现在：前者重综合，后者重分析。

西方注重分析是从文艺复兴开始的，在那以前西方采取的也是整体综合观念——自然科学根本没有分科，由一门无所不包的自然哲学概括之。文艺复兴以后，各门学科逐渐分化出来，分析法才开始大行其道。分析法的要点有三：一是分门别类。将统一的自然科学划分为物理、化学、生物等许多学科，便于集中精力专攻。二是穷根究底。如对物质的研究从分子到原子，再深入到原子核、基本粒子及其内部结构。三是隔离。将研究对象的各个部分及各种影响因素逐个隔离开来，分别加以研究，这是分析法的精髓，在科学方法中具有极其重要的地位。分析法对近代科学的建立和发展起了关键作用，伽利略的自由落体实验就是善用分析法的好例子。自从古希腊亚里士多德以来，人们一直认为重物下落速度比轻物快——石块一松手马上落地，羽毛则在空中慢慢飘落，其实后者是由于空气阻力的影响。伽利略排除空气阻力的影响将地球引力隔离开来研究，在比萨斜塔上以大小两个铅球同时落地，证明了自由落体都具有相同的加速度和速度而与其重量无关。这是一个划时代的实验，不仅开近代力学之先河，而且显示了分析法透过现象揭示本质的强大威力。现代科学发展中虽然也曾利用过综合法，但主要靠的是分析法，可以毫不夸张地说：没有分析法就没有现代科学。

以中国为代表的东方走的是另一条路，学术研究以综合法为主。这源出于东方的哲学思想，无论是儒家的大一统思想，还是道家的“天地虽大，其化均也；万物虽多，其治一也。”（《庄子》天地篇）都是将宇宙当作整体，从全局观点进行综合研究。综合论者虽然也认识到整体由部分所组成，但往往只着眼于各部分之间的外部联系及相互作用，很少分析其内涵。重综合轻分析主导了东方的学术研究，中医学就是一个很好的例子。中医的传统理论基于阴阳二气之调和，